主要且最可靠的诊断工具是所谓的鼻咽分子拭子，它总结了能够通过 RT-PCR 方法检测生物样本中 SARS-Cov -2 病毒基因组 (RNA) 的研究。该测试具有非常高的敏感性和特异性，即它具有很高的能力来识别病毒呈阳性的人，从而尽可能减少假阳性，并且具有同样高的能力来正确识别病毒阳性的人对于这种疾病，这个拭子的结果平均在三/六个小时内就可以得到。分子拭子是首选，例如，在出现疑似症状病例、与出现症状的确诊病例密切接触、医护人员筛查、与脆弱人群接触的受试者或进入封闭社区等情况下，医院。

与分子检测相比，快速抗原检测成本较低，不需要专业人员，出结果更快（30-60分钟）。它是一种有用的工具，特别适用于筛选调查以及需要在短时间内提供控制行动指示的情况。然而，与分子测试不同的是，抗原测试不是通过其酸（RNA）而是通过其蛋白质（抗原）来检测病毒的存在。因此，它通常也被称为抗原测试，其可靠性尚无法与分子测试相比，并且在某些情况下呈阳性可能需要分子测试的确认。唾液测试不会生成绿色通行证。

血清学检测可检测人们是否接触过 SARS-COV-2 病毒，但无法确认是否持续感染，因此，如果呈阳性，则需要进一步进行分子拭子检测才能确诊。为了减少假阳性结果的数量，强烈建议使用特异性不低于95%且敏感性不低于90%的CLIA和/或ELISA类型测试。低于这些阈值，所获得的结果的可靠性不足以满足进行测试的目的。